基本藥物目錄出臺在即，但是從最新的進展來看，其基本藥物目錄本身還是暗藏諸多問題，中投顧問醫藥行業研究員郭凡禮指出，政府允許地方可以增補目錄外藥品、目錄沒有征求公民意見和建議、目錄的后續配套措施還不完善等等方面的因素成為基本藥物目錄出臺在即的三點擔憂。
中投顧問醫藥行業研究員郭凡禮指出，首先，在最近國家允許地方政府可以增加基本藥物目錄外的藥品方面就有很大的一點擔憂，基本藥物目錄現在確定為300多種，這300多種藥品是在“基本、基礎”的條件下一步步篩選得來，可謂來之不易，然而，省一級的政府有了自主權后，怎樣保證增補的多少、增加什么品種在沒有進一步監管政策出臺的情況下有可能使好不容易才“瘦身”成功的基本藥物目錄再度臃腫，從而使基本藥物目錄達不到預期效果。
郭凡禮同時指出，其次，基本藥物目錄從草稿到如今基本制訂都沒有征求過公民的意見和建議，群眾是基本藥物目錄使用的主體和接觸基本藥物目錄最直接的人群之一，他們不僅對藥品有需求，同時也對藥品的價格和療效都有最直觀的感受，但是我國除了各部委的相互利益追逐以及給藥品生產企業發放征求意見稿外，對廣大人民群眾的意見卻從未征詢，這不利于基本藥物目錄達到更好的要求。
中投顧問醫藥行業研究員郭凡禮認為，最后，我國的基本藥物目錄如果正式頒布，其相關的配套政策可能跟不上需求，如在報銷比例上，如何保證基本藥物的報銷比例是高于非基本藥物的；在藥物的選擇上，如何保證醫院及醫療機構把基本藥物目錄里的藥品作為治療藥物的首選；在藥品的零差率銷售上，又該如何補償醫院及醫療機構的利潤損失，這些都是基本藥物目錄發布后不得不考慮的問題。
中投顧問發布的《2009-2012年中國中藥行業投資分析及前景預測報告》指出，基本藥物目錄是我國新醫改下的首個實質性的配套措施，它的發布將對整個醫改開題的成功與否有很大的影響，因此，我國應該加強對增補藥品的監管，廣泛征求群眾意見，盡快出臺相關配套措施，以使基本藥物目錄成為一個合理、有效、規范的藥物目錄。
